上海市中西医结合医院传统医学科目前设全日制门诊。在临床上，依照传统中医整体化的诊病特点，专项研究重症肌无力、慢性疲劳、高脂血症、肥胖病、心悸、失眠等，广泛收治各类疾病，范围涉及内科、外科、皮肤科、妇科等各科病种；在治疗上，除了应用中药汤剂和针剂以外，综合针灸、熏洗、贴敷、拔罐、食疗、情志疗法、康复、导引等治疗手段，遵循“能中不西，先中后西，多中少西”的原则，着力于发挥中医优势、回归中医特色。